Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00052Q96N35 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00052Q96N35 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms