Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRIQ1Q96JM4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRIQ1Q96JM4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRIQ1Q96JM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRIQ1Q96JM4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRRIQ1Q96JM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRRIQ1Q96JM4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRIQ1Q96JM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRIQ1Q96JM4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRRIQ1Q96JM4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
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