Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSL1Q96IY1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms