Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22AQ96IW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms