Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP6Q96FZ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP6Q96FZ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms