Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRQ92752 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRQ92752 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRQ92752 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRQ92752 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRQ92752 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRQ92752 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRQ92752 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRQ92752 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNRQ92752 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNRQ92752 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNRQ92752 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRQ92752 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRQ92752 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRQ92752 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRQ92752 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRQ92752 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRQ92752 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRQ92752 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNRQ92752 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNRQ92752 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNRQ92752 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNRQ92752 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNRQ92752 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNRQ92752 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
TNRQ92752 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNRQ92752 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNRQ92752 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNRQ92752 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNRQ92752 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNRQ92752 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNRQ92752 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNRQ92752 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRQ92752 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRQ92752 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNRQ92752 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNRQ92752 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNRQ92752 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNRQ92752 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNRQ92752 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNRQ92752 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNRQ92752 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNRQ92752 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNRQ92752 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNRQ92752 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNRQ92752 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNRQ92752 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNRQ92752 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNRQ92752 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNRQ92752 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNRQ92752 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNRQ92752 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRQ92752 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRQ92752 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRQ92752 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRQ92752 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRQ92752 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRQ92752 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRQ92752 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRQ92752 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRQ92752 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRQ92752 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNRQ92752 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1441.1 ms