Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPC1Q8WXF1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
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