Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC12Q8WVT3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms