Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSKUQ8WUA8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms