Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms