Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPC24Q8NBT2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms