Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms