Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC33Q8N5R6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC33Q8N5R6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms