Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SVOPQ8N4V2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVOPQ8N4V2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms