Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SFRP1Q8N474 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms