Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms