Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC117Q8IWD4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms