Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A9Q8IVB4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms