Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TXNRD3Q86VQ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD3Q86VQ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD3Q86VQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD3Q86VQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms