Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE3BQ7Z3V4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE3BQ7Z3V4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms