Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms