Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTR9Q6PD62 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms