Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC42EP5Q6NZY7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC42EP5Q6NZY7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms