Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
EFCAB2Q5VUJ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
EFCAB2Q5VUJ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EFCAB2Q5VUJ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms