Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3LQ5T215 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3LQ5T215 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms