Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CEP170Q5SW79 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CEP170Q5SW79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms