Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAVIN4Q5BKX8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN4Q5BKX8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms