Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC178Q5BJE1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms