Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP55Q53EZ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP55Q53EZ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP55Q53EZ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms