Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPRNQ4KMQ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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