Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms