Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NBPF1Q3BBV0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF1Q3BBV0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms