Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL40Q2TBA0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms