Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO4Q2I0M5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO4Q2I0M5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms