Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HLFQ16534 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HLFQ16534 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HLFQ16534 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HLFQ16534 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HLFQ16534 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HLFQ16534 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HLFQ16534 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HLFQ16534 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HLFQ16534 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HLFQ16534 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HLFQ16534 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HLFQ16534 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HLFQ16534 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HLFQ16534 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HLFQ16534 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HLFQ16534 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HLFQ16534 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HLFQ16534 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HLFQ16534 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HLFQ16534 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HLFQ16534 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HLFQ16534 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HLFQ16534 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HLFQ16534 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HLFQ16534 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HLFQ16534 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HLFQ16534 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HLFQ16534 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HLFQ16534 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HLFQ16534 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HLFQ16534 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HLFQ16534 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HLFQ16534 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HLFQ16534 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HLFQ16534 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HLFQ16534 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HLFQ16534 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HLFQ16534 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HLFQ16534 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HLFQ16534 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HLFQ16534 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HLFQ16534 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HLFQ16534 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HLFQ16534 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HLFQ16534 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HLFQ16534 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HLFQ16534 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HLFQ16534 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HLFQ16534 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HLFQ16534 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HLFQ16534 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HLFQ16534 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms