Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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