Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCARF1Q14162 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCARF1Q14162 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCARF1Q14162 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
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