Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASGRF1Q13972 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF1Q13972 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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