Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HDAC1Q13547 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC1Q13547 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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