Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
HMGXB3Q12766 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HMGXB3Q12766 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
HMGXB3Q12766 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HMGXB3Q12766 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HMGXB3Q12766 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
HMGXB3Q12766 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC41.74■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
HMGXB3Q12766 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC41.67■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
HMGXB3Q12766 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
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