Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 DBP8YHR169W 1296 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 DCN1YLR128W 810 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 GAL10YBR019C 2100 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 ETR1YBR026C 1143 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 YPL062WYPL062W 405 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 QCR2YPR191W 1107 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 CCZ1YBR131W 2115 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 FUI1YBL042C 1920 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 AVT3YKL146W 2079 nt5.97□□□□□ -1.45
LSP1Q12230 GUF1YLR289W 1938 nt5.96□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 RPL28YGL103W 450 nt5.96□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 APN1YKL114C 1104 nt5.96□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 YNL019CYNL019C 855 nt5.96□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 YNL033WYNL033W 855 nt5.96□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 ACC1YNR016C 6702 nt5.96□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 RTT106YNL206C 1368 nt5.95□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 EXO1YOR033C 2109 nt5.95□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 SLC1YDL052C 912 nt5.95□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 TDH3YGR192C 999 nt5.95□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 PDR16YNL231C 1056 nt5.95□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 ECM33YBR078W 1290 nt5.95□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 NPL6YMR091C 1308 nt5.95□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 RCK1YGL158W 1539 nt5.94□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 DAL82YNL314W 768 nt5.94□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 ETT1YOR051C 1239 nt5.94□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 MET31YPL038W 534 nt5.94□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 CDC28YBR160W 897 nt5.94□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 ICE2YIL090W 1476 nt5.94□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 ADE4YMR300C 1533 nt5.94□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 UBP9YER098W 2265 nt5.93□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 NTH2YBR001C 2343 nt5.93□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 PHO8YDR481C 1701 nt5.93□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 UBX7YBR273C 1311 nt5.93□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 AUA1YFL010W-A 285 nt5.92□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 COX17YLL009C 210 nt5.92□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 RER2YBR002C 861 nt5.92□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 GAA1YLR088W 1845 nt5.92□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 TRS23YDR246W 660 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 YGL072CYGL072C 360 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 YJR115WYJR115W 510 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 YMR245WYMR245W 621 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 HST2YPL015C 1074 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 PZF1YPR186C 1290 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 VAN1YML115C 1608 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 THP1YOL072W 1368 nt5.91□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 CBP4YGR174C 513 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 MED6YHR058C 888 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 NIT2YJL126W 924 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 CBF1YJR060W 1056 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 CKA2YOR061W 1020 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 snR17bsnR17b 332 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 YCL012CYCL012C 405 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 ELP2YGR200C 2367 nt5.9□□□□□ -1.46
LSP1Q12230 TFC6YDR362C 2019 nt5.9□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 BNA5YLR231C 1362 nt5.9□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 YDL119CYDL119C 924 nt5.89□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 YHR127WYHR127W 732 nt5.89□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 SFK1YKL051W 1062 nt5.89□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 RPL3YOR063W 1164 nt5.89□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 NOP2YNL061W 1857 nt5.89□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 PHO90YJL198W 2646 nt5.88□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 SCM3YDL139C 672 nt5.88□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 TRX2YGR209C 315 nt5.88□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.88□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 GRX4YER174C 735 nt5.87□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 SSP120YLR250W 705 nt5.87□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 TLG2YOL018C 1194 nt5.87□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 UBA2YDR390C 1911 nt5.87□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 PMT2YAL023C 2280 nt5.87□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 STE20YHL007C 2820 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 NGL2YMR285C 1548 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 YDR417CYDR417C 372 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 YGL185CYGL185C 1140 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 YJR085CYJR085C 318 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 PGU1YJR153W 1086 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 OST3YOR085W 1053 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 SOG2YOR353C 2376 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 CAF4YKR036C 1932 nt5.86□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 GLT1YDL171C 6438 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 IWR1YDL115C 1062 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 THI5YFL058W 1023 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 ORM1YGR038W 669 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 THI12YNL332W 1023 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 CRT10YOL063C 2874 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 IMA1YGR287C 1770 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 GCN20YFR009W 2259 nt5.85□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 DDC1YPL194W 1839 nt5.84□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 YEL067CYEL067C 588 nt5.84□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 SEH1YGL100W 1050 nt5.84□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 YHR145CYHR145C 357 nt5.84□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 RPB4YJL140W 666 nt5.84□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 FUN19YAL034C 1242 nt5.84□□□□□ -1.47
LSP1Q12230 OPT1YJL212C 2400 nt5.84□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 ADE3YGR204W 2841 nt5.84□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 VMS1YDR049W 1899 nt5.83□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 YJL206CYJL206C 2277 nt5.83□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 FAP1YNL023C 2898 nt5.83□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 BUD22YMR014W 1560 nt5.83□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 NDC1YML031W 1968 nt5.82□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 EMP46YLR080W 1335 nt5.82□□□□□ -1.48
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