Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprn2P80560 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms