Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2LP62875 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms