Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCALDP61601 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCALDP61601 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCALDP61601 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCALDP61601 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCALDP61601 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCALDP61601 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCALDP61601 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCALDP61601 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCALDP61601 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCALDP61601 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCALDP61601 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCALDP61601 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCALDP61601 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCALDP61601 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCALDP61601 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCALDP61601 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCALDP61601 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCALDP61601 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCALDP61601 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCALDP61601 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCALDP61601 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCALDP61601 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms