Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AQP4P55087 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AQP4P55087 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AQP4P55087 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AQP4P55087 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AQP4P55087 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AQP4P55087 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AQP4P55087 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AQP4P55087 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AQP4P55087 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AQP4P55087 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AQP4P55087 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AQP4P55087 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AQP4P55087 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AQP4P55087 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AQP4P55087 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms