Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFBP49765 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms