Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms