Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 SKG3YLR187W 3081 nt6.39□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 NIT2YJL126W 924 nt6.39□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt6.39□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 SCW10YMR305C 1170 nt6.39□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 RSA4YCR072C 1548 nt6.38□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 FUI1YBL042C 1920 nt6.38□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt6.38□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 LEM3YNL323W 1245 nt6.38□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 NGR1YBR212W 2019 nt6.37□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 SIF2YBR103W 1608 nt6.37□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 HEM3YDL205C 984 nt6.37□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt6.37□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt6.37□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt6.37□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 YAR023CYAR023C 540 nt6.37□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 BRF1YGR246C 1791 nt6.36□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 KTI12YKL110C 942 nt6.36□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 RPL15BYMR121C 615 nt6.36□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 REI1YBR267W 1182 nt6.36□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 HRR25YPL204W 1485 nt6.36□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 AZR1YGR224W 1842 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 SWI1YPL016W 3945 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 BUD16YEL029C 939 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 SUP56tL(CAA)A 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 SUP53tL(CAA)C 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 SUP54tL(CAA)G2 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 YHR140WYHR140W 720 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 RIM101YHL027W 1878 nt6.35□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 MTW1YAL034W-A 870 nt6.34□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 APS1YLR170C 471 nt6.34□□□□□ -1.39
YRF1-2P40105 BUD9YGR041W 1644 nt6.34□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 ISU2YOR226C 471 nt6.33□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 THP1YOL072W 1368 nt6.33□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 ALD6YPL061W 1503 nt6.33□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.33□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 PCL1YNL289W 840 nt6.33□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 KTR5YNL029C 1569 nt6.32□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 VCX1YDL128W 1236 nt6.32□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 AIF1YNR074C 1137 nt6.32□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 MCM6YGL201C 3054 nt6.32□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 XPT1YJR133W 630 nt6.31□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 RGS2YOR107W 930 nt6.31□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 MMT2YPL224C 1455 nt6.31□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 PDI1YCL043C 1569 nt6.31□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 TBF1YPL128C 1689 nt6.31□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 SPR6YER115C 576 nt6.3□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 FAP1YNL023C 2898 nt6.3□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 CTS1YLR286C 1689 nt6.3□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 UGA2YBR006W 1494 nt6.3□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 ARF2YDL137W 546 nt6.3□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 YNL174WYNL174W 573 nt6.3□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 SWI3YJL176C 2478 nt6.29□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 NOP16YER002W 696 nt6.29□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 GSP2YOR185C 663 nt6.29□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 SFB3YHR098C 2790 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 MAG2YLR427W 2013 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 SAP4YGL229C 2457 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 RTC1YOL138C 4026 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 RPA49YNL248C 1248 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 MRI1YPR118W 1236 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 SNU71YGR013W 1863 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 ABF1YKL112W 2196 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 YFL034WYFL034W 3222 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 FOX2YKR009C 2703 nt6.28□□□□□ -1.4
YRF1-2P40105 PIC2YER053C 903 nt6.27□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 FUN19YAL034C 1242 nt6.27□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 TIP41YPR040W 1071 nt6.27□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 LAG2YOL025W 1983 nt6.27□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 SED4YCR067C 3198 nt6.27□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 CIA2YHR122W 696 nt6.26□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 NMA1YLR328W 1206 nt6.26□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 CLP1YOR250C 1338 nt6.26□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 SPL2YHR136C 447 nt6.26□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 ACS1YAL054C 2142 nt6.26□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 ATR1YML116W 1629 nt6.25□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 RFA1YAR007C 1866 nt6.25□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 YPL191CYPL191C 1083 nt6.25□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 RMD9YGL107C 1941 nt6.25□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 HXT4YHR092C 1731 nt6.25□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 TRP3YKL211C 1455 nt6.24□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 IWR1YDL115C 1062 nt6.24□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 RFU1YLR073C 603 nt6.24□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt6.24□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 SSH4YKL124W 1740 nt6.24□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 YJL107CYJL107C 1164 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 RPL14AYKL006W 417 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 IDP3YNL009W 1263 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 DAK1YML070W 1755 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 YGL152CYGL152C 678 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 RFC2YJR068W 1062 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 YKL223WYKL223W 333 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 ETT1YOR051C 1239 nt6.23□□□□□ -1.41
YRF1-2P40105 YJR124CYJR124C 1347 nt6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.1 ms