Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETFBP38117 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETFBP38117 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFBP38117 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ETFBP38117 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ETFBP38117 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ETFBP38117 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ETFBP38117 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFBP38117 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFBP38117 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFBP38117 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFBP38117 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFBP38117 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFBP38117 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFBP38117 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFBP38117 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFBP38117 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFBP38117 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFBP38117 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFBP38117 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFBP38117 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFBP38117 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFBP38117 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFBP38117 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFBP38117 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFBP38117 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFBP38117 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFBP38117 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFBP38117 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFBP38117 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFBP38117 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFBP38117 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFBP38117 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFBP38117 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFBP38117 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFBP38117 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFBP38117 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFBP38117 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFBP38117 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms