Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBRP36941 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBRP36941 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBRP36941 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBRP36941 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBRP36941 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBRP36941 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBRP36941 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBRP36941 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBRP36941 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBRP36941 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBRP36941 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBRP36941 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBRP36941 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBRP36941 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBRP36941 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBRP36941 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBRP36941 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBRP36941 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBRP36941 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBRP36941 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBRP36941 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBRP36941 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBRP36941 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBRP36941 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBRP36941 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBRP36941 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBRP36941 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBRP36941 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBRP36941 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms